टेल्टेल गेम्स का दूसरा सीज़न समाप्त हो गया फ़ौजी का नौकर: भीतर के शत्रु. इससे कोई फर्क नहीं पड़ता कि सीज़न का अंत कैसे होता है, यह बैटमैन और द जोकर दोनों के लिए एक विस्फोटक, भयानक, खूनी अंत है। उन लोगों के लिए घटनाओं का एक त्वरित पुनर्कथन जो पूरे सीज़न में खेल का अनुसरण नहीं कर रहे हैं, वे इसके लिए समझाए गए अंत का एक त्वरित पुनर्कथन पा सकते हैं। फ़ौजी का नौकर: भीतर के शत्रु यहाँ ठीक है.
सीज़न की शुरुआत द रिडलर द्वारा गोथम के आपराधिक भूमिगत क्षेत्र में कुछ व्यक्तियों को आतंकित करने से होती है। रिडलर द्वारा लुसियस फॉक्स को मारने के बाद बैटमैन इसमें शामिल हो जाता है और रिडलर को अपने वश में करने में सफल हो जाता है। बैटमैन द्वारा गोथम में लक्षित रॉकेट लॉन्च करने से रोकने के ठीक बाद रिडलर को मार दिया जाता है। हालाँकि इस बात को लेकर रहस्य बना हुआ है कि रिडलर को किसने मारा, बाद में यह पता चला कि लुसियस की बेटी, टिफ़नी ने अपने पिता की हत्या का बदला लेने के लिए रिडलर को मारने के लिए अपने एक ड्रोन में ज़हर डार्ट का इस्तेमाल किया था।
एक तरफ, इस बात पर निर्भर करता है कि ब्रूस टिफ़नी के साथ कैसा व्यवहार करता है, यह निर्धारित करता है कि क्या वह एक एजेंट के रूप में अमांडा वालर के साथ जुड़ती है, या यदि वह बैटमैन के साथ एक साइडकिक के रूप में जुड़ती है।
पूरे सीज़न में बैटमैन को डार्क नाइट होने और ब्रूस वेन होने के बीच जूझना पड़ता है, जिसके बाद एजेंसी के अमांडा वालर को द पैक्ट नामक समूह में एक अपराधी के रूप में गुप्त रूप से जाने के लिए मजबूर किया जाता है, जिसमें हार्ले क्विन, मिस्टर शामिल हैं। फ़्रीज़, और बैन। वालर बैटमैन/ब्रूस वेन की पहचान का लाभ उठाकर उससे कुछ हद तक अपने लिए काम करवाता है।
द रिडलर के मारे जाने के बाद पैक्ट ने गोथम पर अपना आतंक बढ़ा दिया क्योंकि यह पता चला कि हार्ले क्विन एक ऐसे वायरस के लिए सीरम प्राप्त करना चाह रही है जिसका उपयोग उसके पिता की तरह मानसिक बीमारी से बचने के लिए किया जा सकता है। केवल रिडलर के पास सीरम तक पहुंच थी, लेकिन उसकी मृत्यु के साथ हार्ले भाग्य से बाहर हो गया।
ब्रूस द पैक्ट की योजनाओं को भीतर से बाधित करने के लिए उसके साथ गुप्त रूप से रहता है। वह द पैक्ट के एक अन्य सदस्य, जॉन डो के साथ काम करता है, जिनसे वह मूल रूप से पहले सीज़न के दौरान अरखम एसाइलम में मिला था।
जॉन मानसिक रूप से अस्थिर है, लेकिन जब वे अरखाम शरण में थे तो एक दंगे के दौरान दोनों ने एक-दूसरे की मदद करने के बाद ब्रूस को पसंद करना शुरू कर दिया। इस पर निर्भर करता है कि बैटमैन/ब्रूस अच्छा है या नहीं और जॉन पर भरोसा करना यह निर्धारित करता है कि वह कैसे विकसित होता है।
जबकि ब्रूस और जॉन द पैक्ट का हिस्सा हैं, जिसमें हार्ले, बैन और मिस्टर फ़्रीज़ शामिल हैं, जॉन को हार्ले से प्यार हो जाता है और वह उसे खुश करने के लिए कुछ भी करता है। वह ब्रूस की मदद करने के लिए संघर्ष करता है और साथ ही हार्ले द्वारा उसके सामने रखे गए कार्यों को भी पूरा करता है।
आख़िरकार चीज़ें टूटने लगती हैं, और संधि टूट जाती है क्योंकि अमांडा वालर एजेंसी का उपयोग करके उन पर नकेल कसती है। हार्ले और एजेंसी के बीच चीजें चरम पर पहुंच जाती हैं जब पुल पर उनके बीच गतिरोध हो जाता है जहां हार्ले पुल पर सभी लोगों पर एक घातक वायरस का इस्तेमाल करने की धमकी देता है।
एक महत्वपूर्ण क्षण तब आता है जब जॉन और ब्रूस दोनों हार्ले तक पहुंचना चाहते हैं, लेकिन वालर के मुट्ठी भर एजेंट मर जाते हैं और जॉन ब्रूस से पूछता है कि क्या उसे भरोसा है कि उसने एजेंटों को ठंडे दिमाग से नहीं मारा। यदि ब्रूस जॉन पर भरोसा करता है तो दोनों मिलकर पुल पर हार्ले को रोकते हैं, लेकिन वालर जॉन को धोखा देता है और जॉन मारे जाने से बचने के लिए पुल से कूद जाता है। यदि ब्रूस जॉन पर भरोसा नहीं करने का विकल्प चुनता है, तो जॉन गहरे अंत तक चला जाता है और ब्रूस/बैटमैन पर उसके विश्वास को धोखा देने और केवल संधि को रोकने के साधन के रूप में उपयोग करने का आरोप लगाता है। जॉन पुल पर जाएगा, लेकिन हार्ले को रोकने के बजाय दोनों पुल को उड़ाने और पुल से कूदने से पहले एक चुंबन में गले लगाने के लिए मिलकर काम करते हैं।
सीज़न के दौरान ब्रूस और जॉन का रिश्ता कैसे विकसित हुआ, इसके आधार पर समापन दो अलग-अलग तरीकों से सामने आता है। यदि ब्रूस और जॉन सतर्क लोगों के रूप में टीम बनाते हैं, तो जॉन अपना नाम बदलकर द जोकर रख लेता है। वालर अंत में उन दोनों को निशाना बनाता है, उसे डर होता है कि जॉन अभी भी एक खतरा है, जिसके परिणामस्वरूप बैटमैन और जोकर मिलकर वालर के अस्थायी आत्मघाती दस्ते को मार गिराते हैं जिसमें बेन, हार्ले और कैटवूमन शामिल हैं।
मुठभेड़ में बैटमैन गंभीर रूप से घायल हो जाता है जब जोकर वालर को मारने के प्रयास में विस्फोटकों का उपयोग करके गहरे छोर तक चला जाता है, जिससे छत गिर जाती है क्योंकि बैटमैन बमों को फटने से रोकने का प्रयास करता है।
कैटवूमन बैटमैन की मदद करती है, जो गिरने के बाद मौत के करीब है। जोकर छत पर अराजकता के दौरान वालर को पकड़ लेता है और उसे रिडलर की मौत कबूल करने के लिए मजबूर करने की कोशिश करता है, उसे यह पता नहीं होता कि टिफ़नी ने वास्तव में रिडलर को मार डाला है। गंभीर रूप से घायल बैटमैन का सामना ऐस केमिकल्स प्लांट में जोकर से होता है, जहां बैटमैन जोकर के साथ आमने-सामने की लड़ाई के दौरान वालर और टिफ़नी को बचाने में कामयाब होता है। कई एजेंट जोकर को वश में करने का प्रयास करते हैं लेकिन वह उन्हें चाकुओं से मार डालता है। लड़ाई के दौरान, जोकर कई युक्तियों और तकनीकों का उपयोग करता है जो उसने बैटमैन से एक साथ प्रशिक्षण के दौरान सीखी थीं, जिसके परिणामस्वरूप बैटमैन को और भी अधिक नुकसान हुआ क्योंकि दोनों के बीच एक अंतिम, खूनी टकराव हुआ जिसमें चाकू और बतरंग शामिल थे।
खलनायक के रास्ते में, जोकर और हार्ले एक साथ मिलकर गोथम को आतंकित करते हैं। हार्ले अभी भी एक सीरम चाहती है, और सीरम के बदले में गोथम की सुरक्षा के लिए फिरौती के रूप में वायरस का उपयोग करने का फैसला करती है, वह बैटमैन को भी मरवाना चाहती है। जोकर जानता है कि कोई सीरम नहीं है और ब्रूस वेन वास्तव में बैटमैन है, लेकिन वह उसके करीब रहने के लिए उससे यह जानकारी छिपाना चाहता है। दोनों हत्याएं करते हैं - सीरम पाने के इरादे से हार्ले, और जोकर अपनी दोस्ती को धोखा देने के लिए ब्रूस से बदला लेने के लिए ऐसा कर रहा है।
जोकर ब्रूस को उसके विश्वासघात के लिए प्रताड़ित करने, जिम गॉर्डन को पकड़ने और उसे बैटमैन को जाल में फंसाने के लिए मजबूर करने के लिए एक विस्तृत योजना बनाता है। बदले में, जोकर गॉर्डन को गोथम का एक नक्शा देता है जहां वायरस वाले सभी बम स्थित हैं। हालाँकि, जोकर गॉर्डन के घुटनों पर गोली चलाता है ताकि वह बमों को जल्दी से रोक न सके। जोकर ब्रूस से उसका बैटमैन कवच छीन लेता है और फिर ब्रूस को एक मज़ेदार घर में ले जाता है जहाँ सेलिना, टिफ़नी और अल्फ्रेड को पकड़ लिया गया है। जोकर उन्हें विश्वास पर आधारित एक खेल खेलने के लिए मजबूर करता है ताकि वह ब्रूस को उसे धोखा देने के लिए दंडित कर सके।
ब्रूस और सेलिना हार्ले और जोकर के खिलाफ लड़ने में कामयाब होते हैं। ब्रूस और जोकर पूरे फन हाउस में लड़ते हैं और जोकर बाहर निकलने से पहले ब्रूस को कई बार चाकू मारने में कामयाब होता है। यह सोचने के बाद कि उसने जोकर को मार डाला है, ब्रूस जोकर को पुनर्जीवित करने का प्रयास करता है, तभी जोकर जाग जाता है और ब्रूस की बाजू में चाकू मार देता है। दोनों जमीन पर लेटे हुए थे, जहां ब्रूस जोकर से कहता है कि उसने उनकी दोस्ती को बदसूरत बनाकर उसका दिल तोड़ दिया है, लेकिन जोकर ने खुलासा किया कि चूंकि वे दोस्त नहीं हो सकते इसलिए वे खूबसूरत दुश्मन होंगे।
खलनायक के अंत में जोकर को अरखाम एसाइलम में ब्रूस की बनी गुड़िया के साथ खेलते हुए, उस पर लिपस्टिक लगाते हुए और खुद से बात करते हुए देखा जाता है। विजिलेंटे के अंत में जोकर को अरखाम शरण में देखा जाता है, लेकिन उसे ब्रूस वेन से अप्रत्याशित मुलाकात मिलती है, जिससे उसके चेहरे पर मुस्कान आ जाती है।
दोनों अंतों में, अल्फ्रेड ने फैसला किया कि उसके पास बैटमैन का काफी अनुभव हो चुका है और वह जाने का फैसला करता है। ब्रूस के पास या तो अल्फ्रेड को छोड़ देने का विकल्प है ताकि वह बैटमैन के रूप में अपराध से लड़ना जारी रख सके, या बैटमैन बनना छोड़ दे ताकि अल्फ्रेड बना रहे।
